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ddPCR检测服务

微滴式数字PCR(ddPCR™)技术可实现油包水液滴中核酸分子的绝对定量,它是用于高精度定量靶DNA序列的有力工具,包括cDNA或gDNA的绝对定量,拷贝数变异(CNV)分析和等位基因变异频率(VAF)分析。

 

服务

 

绝对定量

  • 高精度定量目标DNA(# of copies/μl)
  • 无需标准曲线
  • 适用浓度范围广

 

CNV分析

  • 确定基因座删除或复制的拷贝数
  • 高分辨率识别连续拷贝数
  • 目标和参考探针设计

 

VAF分析

  • 实现高灵敏度和高精确度的罕见突变或序列的检测和分析
  • 在高丰度的对应物背景下进行生物标记物检测

 

应用

例,用ddPCR验证CRISPR编辑细胞系中的VAF

用CRISPR-Cas9分别制备了携带BRAF V600E/+和EGFR L858R的HCT116细胞株,从两个细胞系中分离出单个杂合子克隆,并进行细胞扩增,提取基因组DNA,用ddPCR技术检测野生型(VIC)和突变型(FAM)等位基因探针的等位基因变异频率。野生型BRAF和V600E突变型的拷贝数之比为1:1,即两个等位基因中的一个携带突变;而野生型EGFR和L858R突变型的拷贝数之比为2:1,表明杂合子克隆可能受到野生型细胞的污染。

请联系我们4006-020-200或sales@igenebio.com

 

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