OmicsArray™ 自身抗体检测服务（抗原芯片）

       免疫系统通常不会攻击人的自身机体，当自身免疫性疾病发生时，则会产生自我反应的T细胞或循环抗体，去识别宿主蛋白(也称自身抗原)。已有超过100种自身免疫疾病被发现，因此急需能够高灵敏度检测大量自身抗体的工具。
GeneCopoeia的人自免病相关的抗原芯片是一种蛋白抗原芯片，能够高效地检测与许多疾病相关的自身抗体，包括类风湿关节炎、肌肉营养不良、系统性红斑狼疮和 I 型糖尿病。该阵列包含多达120个纯化蛋白，这些蛋白被固定在玻璃载玻片上。这些蛋白均有文献综述报道并已知与特定自身免疫疾病相关。

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        GeneCopoeia的人神经免疫相关的抗原芯片是一种蛋白抗原芯片，能够高效地检测与神经系统疾病相关的自身抗体。该阵列包含多达120个纯化蛋白，这些蛋白被固定在玻璃载玻片上。这些自身抗体可能是导致神经系统疾病的原因，也可能是有用的生物标志物。这些蛋白均有文献综述报道并已知与特定中枢神经系统疾病相关。

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       GeneCopoeia的人癌症和肿瘤抗原芯片是一种蛋白抗原芯片，能够高效地检测癌症患者，特别是那些接受免疫治疗的患者可能产生的自身抗体。该阵列包含多达120个纯化蛋白，这些蛋白被固定在玻璃载玻片上。这些蛋白均有文献综述报道并已知与特定癌症和肿瘤疾病相关。

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        GeneCopoeia的抗磷脂综合症（APS）和中性粒细胞胞外捕获物（NETs）抗原芯片能够强大地检测与系统性自身免疫性疾病有关的抗体，包括抗磷脂综合症（APS）、类风湿性关节炎（RA）和全身性红斑狼疮（SLE）。该芯片包含120种天然形式蛋白固定在载玻片上硝酸纤维素膜表面，这些蛋白均有文献综述报道并已知与特定疾病相关。

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        GeneCopoeia的抗磷脂综合症（APS）和中性粒细胞胞外捕获物（NETs）抗原芯片能够强大地检测与系统性自身免疫性疾病有关的抗体，包括抗磷脂综合症（APS）、类风湿性关节炎（RA）和全身性红斑狼疮（SLE）。该芯片包含120种瓜氨酸化蛋白固定在载玻片上硝酸纤维素膜表面，这些蛋白均有文献综述报道并已知与特定疾病相关。

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         GeneCopoeia的常见过敏原抗原芯片是一种蛋白质微阵列芯片，能够高效地检测与常见过敏原相关的抗体。该芯片包含固相在玻璃载玻片上的70种高质量的过敏原，是基于全面的文献检索筛选出来的，这些过敏原已知和食物成分、植物(树木、灌木)、草、真菌和环境因素引发的和过敏性疾病相关。

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        抗可溶性抗原（extractable nuclear antigen，ENA）和抗核抗体（antinuclear antibodies， ANA）是用于指示系统性自身免疫性风湿病存在的重要生物标志物。GeneCopoeia’s OmicsArray™ ENA and ANA 32-Plex Antigen Array是一种高灵敏度的抗原芯片，包含与自身免疫性疾病最相关的32种ENA和ANA抗原蛋白，可高效检测与系统性自身免疫性风湿病(如系统性红斑狼疮(SLE)、系统性硬化症(SSc)、Sjögren综合征(SS)和混合性结缔组织病(MCTD)等)相关的自身抗体。高质量的纯化核抗原固相在抗原芯片的3D表面上，以确保抗原保持其自然构象。每个抗原都有3种不同浓度的重复，可实现高灵敏性，高重复性的最佳比例的抗原-抗体结合。抗原微阵列包含内部Ig和抗Ig控制点，用于每个微阵列归一化和定量比较。此外，在我们的芯片中使用荧光标记的二抗，可以实现每次实验检测两种不同类型(和亚型)的抗体，最大限度地减少所需样品的要求。

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        抗可溶性抗原（extractable nuclear antigen，ENA）和抗核抗体（antinuclear antibodies， ANA）是用于指示系统性自身免疫性风湿病存在的重要生物标志物。GeneCopoeia的 OmicsArray™ ENA and ANA 32-Plex Antigen Array是一种高灵敏度的抗原芯片，包含与自身免疫性疾病最相关的32种ENA和ANA抗原蛋白，可高效检测与系统性自身免疫性风湿病(如系统性红斑狼疮(SLE)、系统性硬化症(SSc)、Sjögren综合征(SS)和混合性结缔组织病(MCTD)等)相关的自身抗体。高质量的纯化核抗原固相在抗原芯片的3D表面上，以确保抗原保持其自然构象。每个抗原都有3种不同浓度的重复，可实现高灵敏性，高重复性的最佳比例的抗原-抗体结合。抗原微阵列包含内部Ig和抗Ig控制点，用于每个微阵列归一化和定量比较。此外，在我们的芯片中使用荧光标记的二抗，可以实现每次实验检测两种不同类型(和亚型)的抗体，最大限度地减少所需样品的要求。

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        自体免疫性心脏疾病或心脏自身免疫是人体内的免疫系统将心脏抗原误认为是外来物并攻击的结果，从而可能导致风湿性心脏病或心脏炎症。最近的研究还提供了证据，表明自身免疫在扩张型心肌病和高血压等其他类型心脏疾病的发病机制中也起着关键作用。
GeneCopoeia的 OmicsArray™ 心脏自身免疫疾病（Cardiac Autoimmune Disease，CAD）54靶标抗原芯片是一种高灵敏度的蛋白质微阵列芯片，提供了强大的自身抗体检测能力，可以高效检测与自身免疫性引起的心肌炎、心包炎、心内膜炎以及其他心脏疾病相关的自身抗体。
CAD 阵列中包含的抗原选择基于全面的文献检索。高质量的纯化抗原被固相在芯片的三维表面上以确保抗原保持其天然构象。每个微阵列都包含内部 Ig 和抗-Ig 质控点，用于数据归一化和定量分析。此外，我们的微阵列中使用的荧光二抗，可实现在每次实验中检测不同类型（和亚型）的抗体，从而最大限度减少样本量的需求。

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       GeneCopoeia的人感染和疫苗接种相关自身免疫抗原芯片是一种蛋白抗原芯片，能够有效检测与自身免疫疾病相关的抗体，包括类风湿性关节炎，1型糖尿病，以及过敏和COVID-19等病毒性疾病。该阵列包含多达120个纯化蛋白，这些蛋白被固定在玻璃载玻片上。这些蛋白均有文献综述报道并已知与特定疾病相关。

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        GeneCopoeia的OmicsArray干扰素，感染和自身免疫性64-plex相关自身免疫抗原芯片是一种蛋白抗原芯片，能够有效地检测与病毒感染相关的自身免疫性疾病相关的抗体。该芯片包含固相化于载玻片上的64种优质纯化蛋白（包括冠状病毒抗原、干扰素细胞因子和自身抗原)和8种对照蛋白。这些蛋白均已知与感染相关的自身免疫疾病相关并有文献和综述报道。

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       新冠病毒肺炎（COVID-19）是由新型冠状病毒SARS-CoV-2引发的全球性流行病。SARS-CoV-2是一种30Kb的RNA病毒，编码 29 种不同功能的结构和非结构蛋白。病毒结构类似于冠状病毒家族的其它成员如SARS、MERS、NL63、229E、OC43和 HKU1。SARS-CoV-2 感染会引发针对不同抗原表位的抗体的产生，但只有针对 Spike蛋白 (S)的受体结合域(RBD)的抗体才能防止病毒感染。识别结合不同蛋白的抗体以及这些抗体与其他冠状病毒株抗原的交叉反应性非常重要。另一方面，目前已发现COVID-19的严重程度与患者体内针对自身蛋白的自身抗体水平相关。例如，具有高水平抗IFNa自身抗体的COVID-19患者往往有严重的临床症状。因此，全面测量针对多种自身抗原和病毒抗原的抗体在COVID-19研究中同样至关重要。

GeneCopoeia开发了一种新综合性抗原蛋白芯片。120种抗原中包括21种SARS-CoV-2和其他病毒抗原，42种人类细胞因子和趋化因子以及57种人类自身抗原。可用于定量检测COVID-19患者针对多种抗原的各种抗体亚型（例如IgG、IgM、IgA），并用于评估患者对病毒感染和疫苗接种的免疫反应。

该芯片非常适合临床和基础研究应用：

• 检测SARS-CoV-2、其他冠状病毒毒株、流感病毒和呼吸道合胞病毒(RSV)不同抗原的病毒特异性抗体。
• 检测多种人类细胞因子和趋化因子的自身抗体，这对评估细胞因子抗体与新冠肺炎临床表型之间的关系有价值。
• 评估新冠肺炎感染是如何增强人体对各种自身抗原的自身免疫反应（和/或自身抗体）与COVID-19抗体之间的相互作用。
• 监测机体对COVID-19疫苗接种的免疫反应性，确保COVID-19疫苗接种诱导的抗体反应性和检测针对棘突抗原RBD的保护性抗体。

图1.GeneCopoeia冠状病毒感染相关自身抗体芯片的排列。每张芯片包含16个相同的阵列。每个阵列可以检测120个抗原特异性抗体。该芯片对血液(5ul血清或血浆)、唾液、痰液、脊髓液、鼻拭子、眼泪等多种样本类型高度敏感，并能同时检测多种抗体类型(如IgG、IgM、IgA)或亚类。阵列包含57种自身抗原，42种细胞因子，21种病毒抗原、8个内参。

参考文献

1. Bastard et al., Autoantibodies against type I IFNs in patients with life-threatening COVID-19 370, 423
   (2020)
2. Choy KW. SARS-CoV-2 serological cross-reactivity with autoantibodies. Lancet Rheumatol. 2021 Jan;3(1):e15.
   doi: 10.1016/S2665-9913(20)30358-1
3. de Assis RR, et al. Analysis of SARS-CoV-2 antibodies in COVID-19 convalescent blood using a coronavirus
   antigen microarray. Nat Commun. 2021 Jan 4;12(1):6. doi: 10.1038/s41467-020-20095-2
4. Hou X, et al. Serum Protein Profiling Reveals a Landscape of Inflammation and Immune Signaling in
   Early-stage COVID-19 Infection. Mol Cell Proteomics. 2020 Nov;19(11):1749-1759.

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      GeneCopoeia发布的首个用于SARS-CoV-2(野生株和变异株)、SARS-CoV-1、常见冠状病毒和其他常见呼吸相关病毒抗体监测研究的多重血清学检测。这是首个用于在人类血清/血浆中检测SARS-CoV-2(野生株和变异株)抗体(IgG/IgM/IgA)、其他冠状病毒抗体和其他常见呼吸道病毒抗体的基于高度多重微阵列技术的半定量检测方法。

OmicsArray™ COVID-19冠状病毒变异抗原芯片(64-plex)是首个基于微阵列的多重检测方法，能同时检测SARS COV-2蛋白（22种野生型抗原，19种变异抗原），其他冠状病毒种类（SARS、MERS、4 HCOV）和其他呼吸道感染相关病毒（流感、RSV、CMV等）的人类抗体。每张芯片包含16个相同的阵列，可以实现高通量检测。每个阵列中都有人类Ig和抗Ig作为对照，可以实现阵列间的归一化和不同样本之间的比较。同时提供高、低值对照样品。

16组阵列的形式能够同时测试多达16个样品，可在不到3小时的时间内，用2µl的样本，同时检测56种IgG、IgM、IgA 或其他 Ig亚型的抗原特异性抗体，使其成为大规模人群研究的一种高效、极具成本效益的解决方案。最重要的是，该阵列包含了大量在世界各地广泛传播的SARS-CoV-2突变株抗原，包括最具传染性的α、β、γ和δ变体。可见，随着2019新型冠状病毒的快速变异和我们当前面临的巨大挑战，我们的高通量血清学检测将为研究人员和政策制定者提供强有力的信息，帮助他们更好地了解新型冠状病毒的传播，并评估COVID-19疫苗在社区中的保护效力。

GeneCopoeia的OmicsArray™ SCOVID-19冠状病毒变异抗原芯片是检测接种疫苗后或者自然感染后产生多种病毒(包括SARS-CoV-2)的抗体的理想选择，如下图所示。

图1.与人血清反应后的SARS-CoV-2变异抗原芯片图像（1:100）。每张芯片包含16个相同的阵列。每个阵列包含64种抗原，一式四份被固定在玻璃载玻片上。用荧光标记的二级抗体检测IgG（绿色）和IgM（红色）抗体。（点击图像放大）。

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GeneCopoeia的蛋白质组学抗原芯片是一种用于高效检测自身抗体与抗原相互作用的高密度蛋白芯片，包含近16000种在大肠杆菌中表达并固相化在玻璃载玻片上的蛋白质，可以检测样品中蛋白质组层次的蛋白相互作用。该抗原芯片最强大的应用之一是检测患者体液中与自身免疫疾病相关的抗体以及发现潜在的新型自身抗体。

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GeneCopoeia的神经节苷脂和磷脂抗原芯片含有可以检测人类或其他动物样本中的自身抗体的21种抗原。这些自身抗体主要与神经系统自身免疫性疾病相关，包括格林-巴利综合征、脊髓炎、布朗-切卡德综合症和米勒-费雪综合症。

由于这些非蛋白抗原的疏水性强，我们采取了特别的处理方法使得它们能在硝化纤维膜上保持正确的三维结构。

该阵列有以下的重要特性:

• 神经节苷脂和磷脂抗原种类的最大集合。
• 保持抗原的天然构象的点样方式。
• 每种抗原设三个浓度，每个浓度设两个技术重复（每种抗原6个点）。
• 广泛应用于神经系统疾病、抗磷脂综合征(APS)等自身免疫性疾病。

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GeneCopoeia的OmicsArray™抗原微阵列包含多达120个纯化蛋白，这些蛋白被固定在玻璃载玻片上。同时，还包括8个标准化点样。每个载玻片携带16个相同的阵列，因此，可以同时处理多达15个样本以及1个阴性对照。每个样品只需要1 ul血清或50 ul其他体液。

如图1所示，患者样本孵育阵列中，样本中的任意抗体与阵列上的同源抗原结合。随后清洗阵列以去除未结合的抗体和其他蛋白质，然后与Cy3和cy5标记的二抗共孵育。双重标记设计旨在区分样品中存在的免疫球蛋白(Ig)亚型。例如，用Cy3标记的抗IgG二抗检测IgG抗体，用Cy5标记的抗IgM二抗检测IgM抗体。荧光团标记的二抗可用于检测IgA、IgD、IgE、IgG和IgM免疫球蛋白，以及IgG亚类IgG1、IgG2、IgG3和IgG4。

清洗去除未结合的二级抗体后，使用 GenePix®4400A 微阵列扫描仪检测信号。然后使用 GenePix®7.0 软件分析原始数据。

图1：GeneCopoeia的OmicsArray™抗原芯片检测样品中抗体的工作流程

       1. 适用于自身抗原芯片检测的常见样品

血浆、血清、淋巴、尿液、间质液、渗出液、细胞溶解液、分泌液等体液均可用于自身抗原芯片检测分析。

      2. 样品的收集方法

a. 血清：采用不含抗凝剂的采血管采集全血，4℃放置30-45min后，4℃ 3000rpm离心10min，取上清，存于-80℃冰箱；

b. 血浆：采用抗凝剂的采血管采集全血，4℃放置30-45min后，4℃ 3000rpm离心10min，取上清，存于-80℃冰箱；

c. 尿液：收集不添加稳定剂的尿液样本后，4℃ 10000rpm离心1min或5000rpm离心2min，取上清，在干冰/甲醇浴中快速冷冻，储存在-80℃备用。

      3. 样本量

为保证实验的顺利进行，体液样本的样本量请≥50 ul。

      4. 样本寄送要求

a. 快递发出后请于当天将快递单号或专业化冷链物流托运单号及时告知乙方；

b. 收货后乙方会对样品到达状态拍照，若样本送达状态不佳，可能需重新寄送；

c. 体液样本请优先保存于干冰中寄出，干冰用量需足够以确保寄到时仍有干冰剩余；

d. 不能使用干冰的情况下请使用冰袋，冰袋数量需足够以确保寄到使样本温度低于4℃；