高通量miRNA表达差异定量检测阵列 |
MicroRNAs (miRNAs)是一种在转录水平调节基因表达的非编码小RNAs,长度通常在21-23个核苷酸之间。miRNAs在真核生物中高度保守并在细胞通路中起到重要的调节作用。miRNA调节基因的异常表达与癌症、心血管障碍等多种疾病有关。
miProfile™ miRNA qPCR Arrays主要用于对感兴趣组织或细胞中miRNA的表达量进行分析,从而发现与您研究相关的特异miRNAs。每块96孔板(或384孔板)包含84 条(或360条)已交联在反应孔中的PCR引物(正向:miRNA特异引物;反向:通用引物),同时包含12个(或24个)用于监控从反转录到qPCR反应的每个实验步骤效率的对照孔。
每条miRNA引物验证均产生单一扩增产物,融解曲线均呈单一锐锋,电泳条带均呈单一条带,且与目标miRNA相符。由10种人组织混合样本的总RNA经逆转录形成的cDNA作为引物验证的模板。
使用通用的实时定量反应条件,即可简便进行高通量的miRNA表达量检测和分析。逆转录试剂All-in-One miRNA First-Strand cDNA Synthesis Kit 和荧光染料SYBR® Green为基础的定量检测试剂All-in-One qPCR Mix Kit作为被推荐的RT-qPCR试剂与miProfile miRNA qPCR Array配套使用。该系列试剂均经过优化,具有高的灵敏度、效率和特异性。
miRNA qPCR Array 系列产品
miProfile™ miRNome miRNA qPCR Arrays – 高通量人类、小鼠miRNA全基因组miRNA表达差异定量检测阵列
miProfile™ Cancer miRNA qPCR Arrays – 27种不同癌症(肿瘤)相关miRNA表达差异定量检测阵列
miProfile™ Disease and Focus-Group miRNA qPCR Arrays – 11种疾病(或特殊的基因功能群体)相关基因表达差异定量检测阵列
miProfile™ Custom miRNA qPCR Array – 客户定制miRNA表达量差异检测阵列
产品优势
验证引物
- 每条miRNA引物均使用专利算法设计并经过实验确证
性能优越
- 灵敏度高 – 能检测低至10 pg小RNA或20 pg总RNA中的miRNA
- 特异性高 – 能检测miRNAs单碱基差异,每条引物的扩增效率和特异性均经过实验验证
- 线性范围宽 – 能同时检测不同表达水平的miRNA
- 重复性好 – 批间和批内高重复性(R2>0.99)
覆盖范围广、目录产品与客户定制兼容
- 最大可能覆盖全基因组miRNA
- 癌症miRNA组群目录产品
- 客户定制miRNA组群产品
图 1. miRNA PCR array 实验流程(左) 和 miRNA RT-qPCR反应原理(右) |
GeneCopoeia 提供各种miRNA表达差异定量检测阵列,包括miRNome、 cancer、 disease and focus-group等类型的miRNA检测阵列目录产品,同时也提供客户定制服务。
miRNome qPCR arrays
货号 | 产品名称 | 种属 | miRNAs个数 | 平板数 | 文档 |
---|---|---|---|---|---|
QM001 | miProfile™ human miRNome miRNA qPCR arrays | Human | 1,700 (miRBase V. 18) | 21 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM002 | miProfile™ mouse miRNome miRNA qPCR arrays | N/A | 834 (miRBase V.18) | 10 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM003 | miProfile™ human single-nucleotide mismatch miRNA qPCR arrays | Human | 61 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM042 | miProfile™ human miRNome miRNA qPCR arrays | Human | 1,700 (miRBase V.18) | 5 x 384-well plates |
Datasheet Primer list |
QM043 | miProfile™ mouse miRNome miRNA qPCR arrays | Mouse | 834 (miRBase V.18) | 3 x 384-well plates |
Datasheet Primer list |
Cancer miRNA qPCR arrays
货号 | 产品名称 | 种属 | miRNAs个数 | 平板数 | 文档 |
---|---|---|---|---|---|
QM004 | miProfile™ human cancer miRNA qPCR arrays | Human | 420 | 5 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM005 | miProfile™ human breast cancer miRNA qPCR arrays | Human | 168 | 2 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM006 | miProfile™ human colorectal cancer miRNA qPCR arrays | Human | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM007 | miProfile™ human endometrial cancer miRNA qPCR arrays | Human | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM008 | miProfile™ human gastric cancer miRNA qPCR arrays | Human | 80 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM009 | miProfile™ human hepatocellular carcinoma miRNA qPCR arrays | Human | 168 | 2 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM010 | miProfile™ human lung cancer miRNA qPCR arrays | Human | 168 | 2 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM011 | miProfile™ human melanoma miRNA qPCR arrays | Human | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM012 | miProfile™ human brain cancer miRNA qPCR arrays | Human | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM013 | miProfile™ human ovarian cancer miRNA qPCR arrays | Human | 168 | 2 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM014 | miProfile™ human pancreatic cancer miRNA qPCR arrays | Human | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM015 | miProfile™ human prostate cancer miRNA qPCR arrays | Human | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM016 | miProfile™ human head and neck cancer miRNA qPCR arrays | Human | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM017 | miProfile™ human leukemia miRNA qPCR arrays | Human | 168 | 2 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM018 | miProfile™ human bladder cancer miRNA qPCR arrays | Human | 79 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM019 | miProfile™ human lymphoma miRNA qPCR arrays | Human | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM020 | miProfile™ mouse breast cancer miRNA qPCR arrays | Mouse | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM021 | miProfile™ mouse colorectal cancer miRNA qPCR arrays | Mouse | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM022 | miProfile™ mouse hepatocellular carcinoma miRNA qPCR arrays | Mouse | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM023 | miProfile™ mouse lung cancer miRNA qPCR arrays | Mouse | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM024 | miProfile™ mouse melanoma qPCR arrays | Mouse | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM025 | miProfile™ mouse brain cancer miRNA qPCR arrays | Mouse | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM026 | miProfile™ mouse ovarian cancer miRNA qPCR arrays | Mouse | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM027 | miProfile™ mouse pancreatic cancer miRNA qPCR arrays | Mouse | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM028 | miProfile™ mouse prostate cancer miRNA qPCR arrays | Mouse | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM029 | miProfile™ mouse head and neak cancer miRNA qPCR arrays | Mouse | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM030 | miProfile™ mouse leukemia miRNA qPCR arrays | Mouse | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
Disease and focus-group miRNA qPCR arrays
货号 | 产品名称 | 种属 | miRNAs个数 | 平板数 | 文档 |
---|---|---|---|---|---|
QM031 | miProfile™ human inflammatory miRNA qPCR array | Human | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM032 | miProfile™ human heart disease miRNA qPCR array | Human | 84 | 1 x 96-well plate |
Datasheet Primer list |
QM033 | miProfile™ human immunopathology miRNA qPCR array | Human | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM034 | miProfile™ human IPS (Stem cell) miRNA qPCR arrays | Human | 168 | 2 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM035 | miProfile™ human muscle disease miRNA qPCR array | Human | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM036 | miProfile™ human toxicology related miRNA qPCR array | Human | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM037 | miProfile™ human serum and plasma miRNA qPCR arrays | Human | 168 | 2 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM038 | miProfile™ mouse inflammatory miRNA qPCR arrays | Mouse | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM039 | miProfile™ mouse heart disease miRNA qPCR arrays | Mouse | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM040 | miProfile™ mouse immunopathology miRNA qPCR arrays | Mouse | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
QM041 | miProfile™ mouse serum and plasma miRNA qPCR arrays | Mouse | 84 | 1 x 96-well plates |
Datasheet Primer list |
miProfile™ Custom miRNA qPCR Arrays
客户定制miRNA表达量差异定量检测阵列
miProfile™ Custom miRNA qPCR Arrays 特为定量检测客户指定miRNA的表达量差异而设置。每个特定miRNA引物均使用专利算法设计并经过实验确证。根据检测miRNA数量和重复次数,GeneCopoeia可提供6种96孔板和8种384孔板的排布方式供客户选择。定制产品同样包含各种不同种类的对照,用以监测样品质量、RT和PCR反应效率、复孔的重复性等。
- Spike-in reverse transcription control (RT): 监测反转录反应效率
- Positive PCR control (PCR): 验证PCR反应效率
- Housekeeping genes (HK): 作为数据标准化过程中样品的阳性对照(内参基因)
- Negative controls(NC): 监测样品RNA质量
为达到Array产品的最佳性能,推荐使用配套试剂 All-in-One™ miRNA First-Strand cDNA Synthesis Kit、All-in-One™ qPCR Mix。
产品优势
验证引物
- 每个特定miRNA引物均使用专利算法设计并经过实验确证
设计灵活
- 提供6种96孔板和8种384孔板的排布方式供客户选择
性能优越
- 灵敏度高 – 能检测低至10 pg小RNA或20 pg总RNA中的miRNA
- 特异性高 – 能检测miRNAs单碱基差异,每条引物的扩增效率和特异性均经过实验验证
- 线性范围宽 – 能同时检测不同表达水平的miRNA
- 重复性好 – 批间和批内高重复性(R2>0.99)
miRNA qPCR array custom services
货号 | 产品名称 | 种属 | miRNAs个数 | 平板数 | 文档 |
---|---|---|---|---|---|
PAM-CS96 | miProfile™ miRNA qPCR arrays custom services | N/A | Variable | Variable | Variable |
性能数据
Linear Range and Sensitivity (Total RNA)
图 2. 宽广的线性范围和高灵敏度
以梯度倍比稀释的人类结肠癌总RNA为模板,使用All-in-One™ miRNA qRT-PCR Detection Kit检测miR-21 和miR-1260表达量。横坐标为加入总RNA模板量的对数值,纵坐标为对应Ct值,实验数据表明,在20 pg到 2 µg总RNA的线性范围内,试剂盒具有较高的灵敏度。因此可用于多种miRNA表达量,甚至是低表达miRNA的检测。
Inter-Array Reproducibility
图 3. 高批间重复性
采用人类总RNA(10种组织混合物)作为样本,在Bio-Rad iQ5上对miRNA qPCR array (plate A和B)重复性进行分析。计算并比较重复板间的Ct值。结果显示批内重复性R2 > 0.99。同时,批间重复性也达R2 > 0.99(数据未显示)。
Single Nucleotide Mismatches
图 4. miRNA检测特异性
Hsa-miR-29a 和 has-miR-29c具有单碱基差异(B)All-in-One miRNA qRT-PCR Detection Kits可以区分单碱基差异的Hsa-miR-29a和Hsa-miR-29c。miRNA引物分别检测对应的miRNA模板(靶标序列)及单碱基差异的 miRNA模板(脱靶序列),相对分辨率表示脱靶检出量与靶标检出量的百分比(100% x 2 -△Ct)(A)
GeneCopoeia 为各种目录产品或定制miRNA Array产品提供了方便的数据分析工具。对于各种目录产品,可根据产品名称和产品编号,在下表中选择并下载对应的分析工具文件。对于定制产品,可使用在线数据分析工具。
目录产品数据分析工具
请下载目录产品数据分析工具的应用实例,查看如何填写和分析实验数据
定制产品数据分析工具
- All-in-One™ miRNA first-strand cDNA synthesis kits
- All-in-One™ qPCR mix
- RNAzol®RT RNA isolation reagent
- All-in-One™ miRNA qRT-PCR detection kits
- All-in-One™ validated miRNA primers
- miExpress™ pre-miRNA expression clones
- miArrest™ miRNA inhibitor expression clones
- miTarget™ miRNA 3′ UTR target clones
- Lentifect™ pre-miRNA and miRNA inhibitor lentiviral particles
- Complete collection of ExProfile gene qPCR arrays
- ExProfile™ Human Cancer Gene Arrays
- ExProfile™ Gene qPCR Array Custom Service