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细胞株鉴定和质控
研究人员认为,使用细胞株进行实验,需要很好地了解所用细胞株的纯度、种属来源、染色体和遗传特性。实验室培养细胞过程中容易受到微生物、支原体和其他细胞的污染,因此需要对其特性进行定期监测,以鉴定细胞株的身份。
Genecopoeia提供细胞株鉴定试剂和服务,检测重要的遗传标记,包括染色体、DNA指纹、选择性剪接和您感兴趣的基因,从而分析遗传变异,探究转录谱,确保培养无污染。
请联系我们4006-020-200或sales@igenebio.com。
分析遗传变异
Fluorescence in situ hybridization (FISH)检测
用于染色体计数,以及检测与疾病相关的基因突变、扩增和重排导致染色体上基因的物理排列发生大范围的变化。
染色体计数FISH可用于确定染色体拷贝数,用于癌症及其他疾病的诊断和预后。
疾病相关基因FISH可用于检测癌细胞中癌基因的缺失、扩增和重排。
液滴数字PCR(Droplet Digital™ PCR, ddPCR)对检测基因组DNA的绝对定量以进行基因表达分析,可用于变异等位基因频率(variant allele frequency, VAF)的分析和NGS结果的验证。
细胞间的交叉污染是一个普遍而持久的问题。短串联重复序列(Short Tandom Repeat, STR)DNA谱可分析STR标记的多态性,是一种相对简单、低成本、可靠的检测细胞交叉污染的方法。
微卫星不稳性(Microsatellite Instability, MSI)是由于未能纠正DNA复制过程中自发发生的错误,导致某些重复DNA基序的染色体突变积累为微卫星。对结肠和其他肿瘤组织标本进行MSI检测,可探究林奇综合症(Lynch syndrome)或遗传性非息肉病性结直肠癌(hereditary non-polyposis colorectal cancer, HNPCC)的特征。
探究转录谱
RT-qPCR
用于选择性剪接体的定量和基因表达谱的分析。定制的qPCR引物设计用于mRNA的定量和外显子跳跃、内含子保留、5’或3’选择性剪接和其他剪接体的检测,以识别和量化不同的剪接体。
确保培养无污染
支原体检测
支原体污染在细胞培养过程中不易被发现,对细胞的生理和代谢会产生不利影响。因此,建议进行定期检测,以确保培养细胞的纯度。GeneCopoeia提供支原体检测服务和高灵敏的支原体检测试剂盒。