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如何解释你们实际序列与GenBank上序列的差异?

回答:有两种不同的可能或两者兼而有之的可能:1)自然因素,包括遗传多态性、选择性剪接方式、NCBI数据库注释的更新导致基因的多个版本、数据递交者的DNA测序的错误或着模糊不清;2)PCR过程导致的改变。购买ORF克隆的用户往往只是将我们的ORF测序与数据库的基因的某个参照版本的序列进行比较,而把任何的差异都认为是由于PCR产生的突变。通过对将近20,000我们克隆的人类基因的多个克隆的分析,比较了我们的序列与数据库的所有的转录本和相应基因座上的序列包括基因组序列、ESTs、其他cDNA/mRNA 转录本,我们发现大部分差异很明显来源于遗传多态性和选择性剪接方式而不是PCR产生的。 我们的ORF序列与相应的基因组的差异要比数据库发表的基因转录本与相应的基因组的差异要小。当然我们不能完全排除PCR过程导致的突变的可能性,但我们相信这样的可能性是非常低的。我们也可以廉价的提供使用非PCR的方法改变单核苷酸的组成的服务。