您的位置: 首页 > 产品 > reference-standards >

OncoSpot™ NGS标准品NEW!

介绍

GeneCopoeia的OncoSpot™ NGS标准品来源于经基因组编辑技术改造的HCT116细胞株,包含与肿瘤患者相关的临床相关的癌症基因突变位点。基因编辑突变包括单核苷酸突变和缺失。这些细胞系在ISO9001认证的条件下建立,确保了批间的稳定性和重复性。

OncoSpot™ NGS标准品含有基因组DNA和福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的两种产品形式。它们与多种基因组平台兼容,例如NGS、Sanger测序和qPCR,可作为确定工作流程性能标准的理想方法,包括:

  • DNA提取
  • NGS文库构建
  • 样品制备
  • 测序

参考标准品有助于NGS分析开发、质量控制以及检测限、精密度和准确度的验证。

 

 

订购

OncoSpot™ NGS标准品

订购 货号 规格 产品 详情
RM001 5 μg 野生型HCT116标准品 进入了解
RM002 1 μg EGFR ∆E746-A750标准品 进入了解
RM003 1 μg EGFR L858R标准品 进入了解
RM004 1 μg EGFR T790M标准品 进入了解
RM005 1 μg EGFR T790M, C797S标准品 进入了解
RM006 1 μg KRAS G13C标准品 进入了解
RM007 1 μg BRAF V600E标准品 进入了解
RM008 1 μg cKIT D816V标准品 进入了解
RM009 1 μg AKT E17K标准品 进入了解
RM201 1 片 野生型HCT116标准品(FFPE) 进入了解
RM202 1 片 EGFR ∆E746-A750标准品(FFPE) 进入了解
RM203 1 片 EGFR L858R标准品(FFPE) 进入了解
RM204 1 片 EGFR T790M标准品(FFPE) 进入了解
RM205 1 片 EGFR T790M, C797S标准品(FFPE) 进入了解
RM206 1 片 KRAS G13C标准品(FFPE) 进入了解
RM207 1 片 BRAF V600E标准品(FFPE) 进入了解
RM208 1 片 cKIT D816V标准品(FFPE) 进入了解
RM209 1 片 AKT E17K标准品(FFPE) 进入了解

 

 

 

 

 

FAQs

1. 标准品有什么用?

单基因标准品用于Sanger测序和PCR检测体细胞突变。这些标准品突变以肿瘤学为基础,主要用于基因检测,包括gDNA、RNA和非FFPE等产品形式。

Genecopoeia提供高特征、生物学相关的纯合子OncoSpot™标准品,具有一致性和可靠性。在您的工作流程中使用这些标准品,通过对分析的灵敏度、特异性和准确性的评估来优化实验流程。

标准品优势:

  • 在检测病人样本前优化DNA提取方案
  • 减少操作流程变化产生的对下游结果的影响
  • 建立检测限
  • 在质量控制过程中准确地评估批间可变性
  • 建立诊断试验的工具

2. 标准品是如何获得的?

Genecopoeia使用基因组编辑技术对细胞进行精准的基因编辑后获得。这些细胞系在ISO9001认证的条件下建立,确保了批间的稳定性和重复性。 另外,这些用于标准品制作的细胞系本身也会存在内源性的突变,这种类型的突变在我们分析的过程中也被称为突变。

3. 如何评估gDNA的质量?

我们使用琼脂糖凝胶电泳和分光光度计(A260/A280)测定每一个批次的质量。

4. 如何评估单点突变gDNA标准品的浓度?

我们使用Qubit仪器进行定量。

5. gDNA标准品如何生产的?

我们通过提取人单克隆细胞系基因组DNA获得gDNA标准品。不管是突变型还是野生型的gDNA标准品都经过Sanger测序。我们提供50ng/ul的gDNA标准品。

6. FFPE标准品是如何生产的?

标准品细胞株福尔马林处理后用石蜡包埋得到FFPE标准品。我们提供20um厚直径为5mm的FFPE标准品。

7. 如何提取FFPE标准品中的DNA?

回收率在很大程度上取决于FFPE的提取方法。我们使用QIAamp DNA FFPE组织提取试剂盒,每片FFPE可得到≥400ng DNA。该试剂盒说明可得到的范围是200ng-500ng。注意关键的一点是,请按照gDNA的提取步骤,而不是总核酸的提取步骤进行。

8. FFPE DNA提取得率低于预期,如何提高?

如果按照正确的提取步骤进行提取得到低于50ng,有可能是细胞在去石蜡过程中丢失了。因此,用二甲苯处理FFPE的时候要在原管中进行。如果按照正常的提取步骤进行提取得到50-200ng,有可能是洗脱的过程中DNA没有完全通过柱子。这种情况下,通过两次50ul的洗脱比一次100ul的洗脱能得到更多的DNA。

9. 如何用DNA标准品制作稀释曲线去测定我的检测限(LOD)?

制作检测限曲线,需要1个突变型DNA标准品和1个野生型DNA标准品。根据DNA标准品的应用,检测限稀释曲线的等位基因的频率可能会不一样。如:

  • Sanger测序 15-25%
  • qPCR 1%
  • NGS <1%