OmicsArray™ 自身抗体检测服务（抗原芯片）
自身抗体与多种自身免疫性疾病和免疫系统失调有关。自身抗体检测服务主要用于自身抗体的检测，用抗原芯片分析针对一系列自身抗原的自身抗体图谱，可对自身免疫性疾病、过敏、肿瘤反应、接种疫苗和感染、器官移植等的免疫反应进行大规模分析，为疾病预警和诊断、治疗方法选择、疗效评估、预后分析等科学研究提供依据，也是发现具有临床价值的抗体标记、研究疾病发病机制的有力工具。 Genecopoeia提供用于转化医学研究的，基于抗原芯片的自身抗体检测服务。OmicsArray™自身抗体检测芯片能用于以下研究，包括：
- 各种自身免疫性疾病，如：系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎、糖尿病、混合结缔组织病、Sjøgren综合症、硬皮病、多肌炎、皮肌炎等等；
- 过敏性疾病；
- 传染性疾病；
- 脑神经失调或神经障碍；
- 病毒疫苗的开发及疫苗接种后对自身免疫反应的监测，如SARS-CoV-2、其他冠状病毒株、流感病毒和呼吸道合胞病毒（RSV）等。
- 癌症生物标志物和免疫调节治疗毒性监测；
- 器官移植效果评估；
- 药物筛选和临床试验。
产品优势
- 高多重性: 与传统的ELISA法每孔检测1个抗体相比，自身抗原阵列每孔可检测>120个自身抗体；
- 高通量: 每张玻片可同时处理16个样品，多张玻片可并行操作；
- 高灵活性: 结合不同抗原(蛋白质、多肽、核酸等)，检测不同类型和亚型的抗体；
- 小样本量: 5ul血清或其他体液即可满足；
- 成本低: 低于ELISA试剂盒1/10的价格；
- 高灵敏度: 结果的动态范围在1-65000；
- 半定量: 基于标准曲线的相对定量。
技术简介
什么是自身抗体/抗原？ 在自身免疫性疾病发生、发展的过程中，引起自身免疫应答的自身组织成分被称为自身抗原，包括隐藏的自身抗原（在胚胎期从未与自身淋巴细胞接触过，机体不能识别为自身物质）和修饰的自身抗原（在感染、药物、烧伤、电离辐射等因素影响下，自身组织的构象发生改变，成为自身抗原）。机体产生自身抗原时，由于免疫系统将其识别为异己部分，会产生对应的自身抗体进行抵抗。 什么是抗原芯片？ 自身抗原芯片，是指以蛋白质分子作为配基,将其有序地固定在固相载体的表面形成微阵列，用标记了荧光的蛋白质或其他它分子与之作用，洗去未结合的成分，经荧光扫描等检测方式测定芯片上各点的荧光强度，来分析蛋白之间或蛋白与其它分子之间的相互作用关系。 为什么要做这个服务？ 这些自身抗原或自身抗体在疾病表型显现的前期往往已经产生，并且表达量通常随着病情的演化呈现出一定的趋势，是一类重要的疾病生物标志物。越来越多科研人员将目光定格在自身抗体相关标志物的研究上，力求在自身抗体层面寻找生物标志物，建立诊断、预后、药效评估的多参数模型。 为了满足疾病诊断，预后判断等多方面的广泛而长期的需求，疾病生物标志物的发现研究不可或缺。基于疾病相关自身抗体的标志物因在多种疾病中广泛存在，且可通过血液样本而方便地实现检测而备受关注。
应用
抗原芯片在自体免疫中的应用，包括疾病诊断，监控疾病进程及治疗效果，致病机制研究，为病人提供个性化治疗等。
- 自身免疫性疾病: 如：系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎、糖尿病、混合结缔组织病、Sjøgren综合症、硬皮病、多肌炎等等；
- 过敏性疾病
- 传染性疾病
- 脑神经失调或神经障碍
- 癌症生物标志物和免疫调节治疗毒性监测
- 器官移植效果评估
- 药物筛选和临床试验
Genecopoeia提供的OmicsArray™ 自身抗体检测服务类型包括：如需定制自身抗体检测芯片，请点击此处，填写服务表格。
免疫系统通常不会攻击人的自身机体，当自身免疫性疾病发生时，则会产生自我反应的T细胞或循环抗体，去识别宿主蛋白(也称自身抗原)。已有超过100种自身免疫疾病被发现，因此急需能够高灵敏度检测大量自身抗体的工具。 GeneCopoeia的人自免病相关的抗原芯片是一种蛋白抗原芯片，能够高效地检测与许多疾病相关的自身抗体，包括类风湿关节炎、肌肉营养不良、系统性红斑狼疮和 I 型糖尿病。该阵列包含多达120个纯化蛋白，这些蛋白被固定在玻璃载玻片上。这些蛋白均有文献综述报道并已知与特定自身免疫疾病相关。
*目前有PA001-V2和PA001-V3两个版本在售。两者的抗原种类有19种抗原的区别，PA001-V3的特有抗原大多与炎性肌炎有关。
| 部分抗原信息 | |||
|
lg control (hlgG+hlgM) |
alpha-actinine |
Beta2 glycoprotein 1 |
Chondroltin Sulfate C |
|
CollagenⅠ |
CollagenⅡ |
Cytochrome C |
Histone H1 |
|
Hemocyanin |
BPI |
LC1 |
PL-7 |
|
PL-12 |
Ro/SSA(60 kD) |
Myelin basic protein (MBP) |
CD8 |
* 我们还提供定制服务： 请点击联系我们或拨打400-6020-200。
GeneCopoeia的人神经免疫相关的抗原芯片是一种蛋白抗原芯片，能够高效地检测与神经系统疾病相关的自身抗体。该阵列包含多达120个纯化蛋白，这些蛋白被固定在玻璃载玻片上。这些自身抗体可能是导致神经系统疾病的原因，也可能是有用的生物标志物。这些蛋白均有文献综述报道并已知与特定中枢神经系统疾病相关。
| 部分抗原信息 | |||
|
Neuronal Pentraxin-1/NPTX1 |
GAPDH |
Lymphocyte Antigen 6H/LY6H |
Protein kinase C, gamma(PRKCG) |
|
Caspr2 |
Amylold-like Protein 1(APLP-1) |
MGluR5 |
Dipeptidyl Peptidase 6(DPP6) |
|
AQP4(CB) |
Receptor Accessory Protein 2(REEP2) |
PCDHA1 |
Cytokeratin 10 |
|
GAD1/GAD67 |
CX43/GJA1 |
Olfactomedin-4 |
MMP-14 |
* 我们还提供定制服务： 请点击联系我们或拨打400-6020-200。
GeneCopoeia的人癌症和肿瘤抗原芯片是一种蛋白抗原芯片，能够高效地检测癌症患者，特别是那些接受免疫治疗的患者可能产生的自身抗体。该阵列包含多达120个纯化蛋白，这些蛋白被固定在玻璃载玻片上。这些蛋白均有文献综述报道并已知与特定癌症和肿瘤疾病相关。
| 部分抗原信息 | |||
|
ANXA1 |
BAFF |
CA15-3 |
CA125 |
|
ERP29 |
FUCA1 |
Glutamate |
decarboxylase-65/GAD2 |
|
AQP4(CB) |
HuD/ELAVL4 |
IL-2 |
P53 |
|
TNF-alpha |
TNF-beta |
VEGF-165 |
MAG |
* 我们还提供定制服务： 请点击联系我们或拨打400-6020-200。
抗磷脂综合症和中性粒细胞胞外捕获物相关的天然形式蛋白自身抗体检测-PA004（120种抗原）
GeneCopoeia的抗磷脂综合症（APS）和中性粒细胞胞外捕获物（NETs）抗原芯片能够强大地检测与系统性自身免疫性疾病有关的抗体，包括抗磷脂综合症（APS）、类风湿性关节炎（RA）和全身性红斑狼疮（SLE）。该芯片包含120种天然形式蛋白固定在载玻片上硝酸纤维素膜表面，这些蛋白均有文献综述报道并已知与特定疾病相关。
| 部分抗原信息 | |||
|
Azurocidin |
B4-integrin |
Calreticulin |
DEFA3 |
|
Enolase |
Flagellin |
HMGB1 |
IFN-A2 |
|
Laminin |
MDA5 |
MNDA |
PCNA |
|
Vimentin |
SOX2 |
Ribo P0 |
Nucleolin |
* 我们还提供定制服务： 请点击联系我们或拨打400-6020-200。
抗磷脂综合症和中性粒细胞胞外捕获物相关的瓜氨酸化蛋白自身抗体检测-PA005（120种抗原）
GeneCopoeia的抗磷脂综合症（APS）和中性粒细胞胞外捕获物（NETs）抗原芯片能够强大地检测与系统性自身免疫性疾病有关的抗体，包括抗磷脂综合症（APS）、类风湿性关节炎（RA）和全身性红斑狼疮（SLE）。该芯片包含120种瓜氨酸化蛋白固定在载玻片上硝酸纤维素膜表面，这些蛋白均有文献综述报道并已知与特定疾病相关。
| 部分抗原信息 | |||
|
Azurocidin |
B4-integrin |
Calreticulin |
DEFA3 |
|
Enolase |
Flagellin |
HMGB1 |
IFN-A2 |
|
Laminin |
MDA5 |
MNDA |
PCNA |
|
Vitronectin |
SOX2 |
Ribo P0 |
Fibrinogen |
* 我们还提供定制服务： 请点击联系我们或拨打400-6020-200。
GeneCopoeia的常见过敏原抗原芯片是一种蛋白质微阵列芯片，能够高效地检测与常见过敏原相关的抗体。该芯片包含固相在玻璃载玻片上的70种高质量的过敏原，是基于全面的文献检索筛选出来的，这些过敏原已知和食物成分、植物(树木、灌木)、草、真菌和环境因素引发的和过敏性疾病相关。
| 部分抗原信息 | |||
|
Mite, Food/Storage Acarus siro |
Ara h 1.0101 |
Cat Dander |
Dog Dander |
|
Banana Musa acuminata |
Beef taurus |
Milk, Bovine_Bos taurus |
Peanut |
|
Salmon Salmo salar |
Aspergillus flavus |
Bermuda |
Phl p 1.0102 |
|
CockRoAcH |
Mite, Dermatophagoides |
Cor a 14.0101 |
Wheat |
* 我们还提供定制服务： 请点击联系我们或拨打400-6020-200。
抗可溶性抗原（extractable nuclear antigen，ENA）和抗核抗体（antinuclear antibodies， ANA）是用于指示系统性自身免疫性风湿病存在的重要生物标志物。GeneCopoeia的 OmicsArray™ ENA and ANA 32-Plex Antigen Array是一种高灵敏度的抗原芯片，包含与自身免疫性疾病最相关的32种ENA和ANA抗原蛋白，可高效检测与系统性自身免疫性风湿病(如系统性红斑狼疮(SLE)、系统性硬化症(SSc)、Sjögren综合征(SS)和混合性结缔组织病(MCTD)等)相关的自身抗体。高质量的纯化核抗原固相在抗原芯片的3D表面上，以确保抗原保持其自然构象。每个抗原都有3种不同浓度的重复，可实现高灵敏性，高重复性的最佳比例的抗原-抗体结合。抗原微阵列包含内部Ig和抗Ig控制点，用于每个微阵列归一化和定量比较。此外，在我们的芯片中使用荧光标记的二抗，可以实现每次实验检测两种不同类型(和亚型)的抗体，最大限度地减少所需样品的要求。
| 部分抗原信息 | |||
|
Histone Core |
Histone H4 |
SSA-Ro60 |
U1-sn-RNP BB |
|
RNP/Sm |
SmD1 |
Nucleosome |
CENP-A |
* 我们还提供定制服务： 请点击联系我们或拨打400-6020-200。
自体免疫性心脏疾病或心脏自身免疫是人体内的免疫系统将心脏抗原误认为是外来物并攻击的结果，从而可能导致风湿性心脏病或心脏炎症。最近的研究还提供了证据，表明自身免疫在扩张型心肌病和高血压等其他类型心脏疾病的发病机制中也起着关键作用。 GeneCopoeia的 OmicsArray™ 心脏自身免疫疾病（Cardiac Autoimmune Disease，CAD）54靶标抗原芯片是一种高灵敏度的蛋白质微阵列芯片，提供了强大的自身抗体检测能力，可以高效检测与自身免疫性引起的心肌炎、心包炎、心内膜炎以及其他心脏疾病相关的自身抗体。 CAD 阵列中包含的抗原选择基于全面的文献检索。高质量的纯化抗原被固相在芯片的三维表面上以确保抗原保持其天然构象。每个微阵列都包含内部 Ig 和抗-Ig 质控点，用于数据归一化和定量分析。此外，我们的微阵列中使用的荧光二抗，可实现在每次实验中检测不同类型（和亚型）的抗体，从而最大限度减少样本量的需求。
| 部分抗原信息 | |||
|
ACO2 |
BCKDHA |
CDH8 |
DSC1 |
|
GAPDH |
ITGB1 |
M1MR |
MYL1 |
* 我们还提供定制服务： 请点击联系我们或拨打400-6020-200。
感染和疫苗接种相关的自身抗体检测-PA010（120种抗原）
GeneCopoeia的人感染和疫苗接种相关自身免疫抗原芯片是一种蛋白抗原芯片，能够有效检测与自身免疫疾病相关的抗体，包括类风湿性关节炎，1型糖尿病，以及过敏和COVID-19等病毒性疾病。该阵列包含多达120个纯化蛋白，这些蛋白被固定在玻璃载玻片上。这些蛋白均有文献综述报道并已知与特定疾病相关。
| 部分抗原信息 | |||
|
Myosin |
Alpha enolase |
Beef_Bos taurus |
Casein |
|
CMV-G |
COVID 19 SPIKE S1 |
Diphtheria Toxin |
Echovirus type 9 |
|
House Dust |
GBM |
Influenza H1N1 |
La/SSB |
| MERS-CoV NCP | Norovirus vp1 |
SARS1 S1 |
Vitronectin |
* 我们还提供定制服务： 请点击联系我们或拨打400-6020-200。
干扰素，感染和自身免疫性相关自身免疫抗体检测-PA011（64种抗原）
GeneCopoeia的OmicsArray干扰素，感染和自身免疫性64-plex相关自身免疫抗原芯片是一种蛋白抗原芯片，能够有效地检测与病毒感染相关的自身免疫性疾病相关的抗体。该芯片包含固相化于载玻片上的64种优质纯化蛋白（包括冠状病毒抗原、干扰素细胞因子和自身抗原)和8种对照蛋白。这些蛋白均已知与感染相关的自身免疫疾病相关并有文献和综述报道。
| 部分抗原信息 | |||
|
Aldolase C |
CD8 |
Complement C1q |
Complement C1q |
|
GAD65 |
GAD65 |
GAD65 |
IFN-a C |
|
IFN-a D |
IFN-a H2 |
IFN-a/IFN-a1 |
IFN-b/IFN-b1 |
|
IFN-L2/IL28A |
IFN-L2/IL28A |
Nucleosome |
Nup62 |
* 我们还提供定制服务： 请点击联系我们或拨打400-6020-200。
新冠病毒肺炎（COVID-19）是由新型冠状病毒SARS-CoV-2引发的全球性流行病。SARS-CoV-2是一种30Kb的RNA病毒，编码 29 种不同功能的结构和非结构蛋白。病毒结构类似于冠状病毒家族的其它成员如SARS、MERS、NL63、229E、OC43和 HKU1。SARS-CoV-2 感染会引发针对不同抗原表位的抗体的产生，但只有针对 Spike蛋白 (S)的受体结合域(RBD)的抗体才能防止病毒感染。识别结合不同蛋白的抗体以及这些抗体与其他冠状病毒株抗原的交叉反应性非常重要。另一方面，目前已发现COVID-19的严重程度与患者体内针对自身蛋白的自身抗体水平相关。例如，具有高水平抗IFNa自身抗体的COVID-19患者往往有严重的临床症状。因此，全面测量针对多种自身抗原和病毒抗原的抗体在COVID-19研究中同样至关重要。 GeneCopoeia开发了一种新综合性抗原蛋白芯片。120种抗原中包括21种SARS-CoV-2和其他病毒抗原，42种人类细胞因子和趋化因子以及57种人类自身抗原。可用于定量检测COVID-19患者针对多种抗原的各种抗体亚型（例如IgG、IgM、IgA），并用于评估患者对病毒感染和疫苗接种的免疫反应。
该芯片非常适合临床和基础研究应用：
- 检测SARS-CoV-2、其他冠状病毒毒株、流感病毒和呼吸道合胞病毒(RSV)不同抗原的病毒特异性抗体。
- 检测多种人类细胞因子和趋化因子的自身抗体，这对评估细胞因子抗体与新冠肺炎临床表型之间的关系有价值。
- 评估新冠肺炎感染是如何增强人体对各种自身抗原的自身免疫反应（和/或自身抗体）与COVID-19抗体之间的相互作用。
- 监测机体对COVID-19疫苗接种的免疫反应性，确保COVID-19疫苗接种诱导的抗体反应性和检测针对棘突抗原RBD的保护性抗体。
图1.GeneCopoeia冠状病毒感染相关自身抗体芯片的排列。每张芯片包含16个相同的阵列。每个阵列可以检测120个抗原特异性抗体。该芯片对血液(5ul血清或血浆)、唾液、痰液、脊髓液、鼻拭子、眼泪等多种样本类型高度敏感，并能同时检测多种抗体类型(如IgG、IgM、IgA)或亚类。阵列包含57种自身抗原，42种细胞因子，21种病毒抗原、8个内参。
参考文献
- Bastard et al., Autoantibodies against type I IFNs in patients with life-threatening COVID-19 370, 423 (2020)
- Choy KW. SARS-CoV-2 serological cross-reactivity with autoantibodies. Lancet Rheumatol. 2021 Jan;3(1):e15. doi: 10.1016/S2665-9913(20)30358-1
- de Assis RR, et al. Analysis of SARS-CoV-2 antibodies in COVID-19 convalescent blood using a coronavirus antigen microarray. Nat Commun. 2021 Jan 4;12(1):6. doi: 10.1038/s41467-020-20095-2
- Hou X, et al. Serum Protein Profiling Reveals a Landscape of Inflammation and Immune Signaling in Early-stage COVID-19 Infection. Mol Cell Proteomics. 2020 Nov;19(11):1749-1759.
| 部分抗原信息 | |||
|
ACE2 |
BAFF |
CD4 |
DFS70 |
|
EBV |
Fibrinogen |
GBM |
Histone |
|
IFN-epsilon |
LKM-1 |
MDA5 |
Nup62 |
|
PCNA |
Ro-52 |
SARS S2 |
TIF1-r |
* 我们还提供定制服务： 请点击联系我们或拨打400-6020-200。
COVID-19冠状病毒变异抗原的自身抗体检测PA013（58种抗原）
GeneCopoeia发布的首个用于SARS-CoV-2（野生株和变异株）、SARS-CoV-1、常见冠状病毒和其他常见呼吸相关病毒抗体监测研究的多重血清学检测。这是首个用于在人类血清/血浆中检测SARS-CoV-2（野生株和变异株）抗体（IgG/IgM/IgA）、其他冠状病毒抗体和其他常见呼吸道病毒抗体的基于高度多重微阵列技术的半定量检测方法。 OmicsArray™ COVID-19冠状病毒变异抗原芯片（66-plex）是首个基于微阵列的多重检测方法，能同时检测SARS COV-2蛋白（22种野生型抗原，19种变异抗原），其他冠状病毒种类（SARS、MERS、4 HCOV）和其他呼吸道感染相关病毒（流感、RSV、CMV等）的人类抗体。每张芯片包含16个相同的阵列，可以实现高通量检测。每个阵列中都有人类Ig和抗Ig作为对照，可以实现阵列间的归一化和不同样本之间的比较。同时提供高、低值对照样品。 16组阵列的形式能够同时测试多达15个样品（1个对照组），可在不到3小时的时间内，用2 µl的样本，同时检测58种IgG、IgM、IgA或其他Ig亚型的抗原特异性抗体，使其成为大规模人群研究的一种高效、极具成本效益的解决方案。最重要的是，该阵列包含了大量在世界各地广泛传播的SARS-CoV-2突变株抗原，包括最具传染性的α、β、γ和δ变体。可见，随着2019新型冠状病毒的快速变异和我们当前面临的巨大挑战，我们的高通量血清学检测将为研究人员和政策制定者提供强有力的信息，帮助他们更好地了解新型冠状病毒的传播，并评估COVID-19疫苗在社区中的保护效力。 GeneCopoeia OmicsArray™ SCOVID-19冠状病毒变异抗原芯片是检测接种疫苗后或者自然感染后产生多种病毒（包括SARS-CoV-2）的抗体的理想选择，实验效果如下图。
图1.与人血清反应后的SARS-CoV-2变异抗原芯片图像（1:100）。每张芯片包含16个相同的阵列。每个阵列包含66种抗原，一式四份被固定在玻璃载玻片上。用荧光标记的二级抗体检测IgG（绿色）和IgM（红色）抗体。（点击图像放大）。
| 部分抗原信息 | |||
|
SARS1 NP |
SARS1 S1
|
SARS1 S1 RBD
|
SARS2 E
|
|
SARS2 N |
SARS2 NCP
|
SARS2 S1
|
SARS2 S1 RBD
|
|
MERS-CoV NP |
MERS-CoV S
|
Influenza A
|
Influenza B
|
|
HCoV-HKU1 S1 |
HCoV-HKU1 S
|
Norovirus vp1
|
RSV grade II
|
* 我们还提供定制服务： 请点击联系我们或拨打400-6020-200。
神经节苷脂和磷脂抗原的自身抗体检测-PA015（21种抗原）
GeneCopoeia的神经节苷脂和磷脂抗原芯片含有可以检测人类或其他动物样本中的自身抗体的21种抗原。这些自身抗体主要与神经系统自身免疫性疾病相关，包括格林-巴利综合征、脊髓炎、布朗-切卡德综合症和米勒-费雪综合症。
由于这些非蛋白抗原的疏水性强，我们采取了特别的处理方法使得它们能在硝化纤维膜上保持正确的三维结构。
该阵列有以下的重要特性:
- 神经节苷脂和磷脂抗原种类的最大集合。
- 保持抗原的天然构象的点样方式。
- 每种抗原设三个浓度，每个浓度设两个技术重复（每种抗原6个点）。
- 广泛应用于神经系统疾病、抗磷脂综合征(APS)等自身免疫性疾病。
| 部分抗原信息 | |||
|
CL |
GD1A
|
CD2
|
CD3
|
|
GM1 |
GM2
|
GM3
|
GM4
|
|
GQ1B |
GT1A
|
PA
|
S-1-P
|
|
SM |
Sulfatide
|
IgC
|
aIgC
|
* 我们还提供定制服务： 请点击联系我们或拨打400-6020-200。
自身免疫性心肌炎和肌炎抗原检测阵列-PA016（120种抗原）
自身免疫性心肌炎和肌炎是影响心脏和肌肉系统的自身免疫性疾病。这些疾病的特征是心肌和其他肌肉系统的炎症，通常与针对心脏抗原、肌肉抗原和神经元-肌肉递质抗原的自身抗体有关。GeneCopoeia的OmicsArray™自身免疫性心肌炎和肌炎（AMM）抗原阵列是一种高灵敏度的蛋白质微阵列，具有强大的抗体分析功能，可检测与自身免疫性心肌炎、肌炎和其他自身免疫性疾病相关的自身抗体。芯片中包含的 120 种抗原是根据全面的文献检索筛选出来的。高质量的纯化抗原被涂布在微芯片的三维表面上，以确保抗原保持其天然构象。每个阵列都包含内部 Ig 和抗 Ig 对照，用于归一化和量化。此外，我们的微阵列中使用了荧光二抗，可在每次实验中检测不同类型（和亚型）的抗体，从而最大限度地减少了所需的样本量。
| 部分抗原信息 | |||
|
20S P |
ATP1A1
|
CD4
|
CD8
|
|
EDNRA |
ITGB1
|
Ku (p70/80)
|
M2
|
|
MPO |
SRP14
|
Tn-ITC
|
PKP2
|
|
Jo-1 |
dsDNA
|
Ig control
|
anti-Ig control
|
* 我们还提供定制服务： 请点击联系我们或拨打400-6020-200。
| 部分抗原信息 | |||
|
Musk (ECD) |
Musk (ICD)
|
Myosin
|
RyR1
|
|
S100A12 |
Titin (TTN)
|
Tropomyosin
|
UPAR
|
|
Vinculin |
LRP4
|
Ig control
|
anti-Ig control
|
* 我们还提供定制服务： 请点击联系我们或拨打400-6020-200。
自身抗体与多种自身免疫性疾病和免疫系统失调有关。自身抗体检测服务主要用于自身抗体的检测，用抗原芯片分析针对一系列自身抗原的自身抗体图谱，可对自身免疫性疾病、过敏、肿瘤反应、接种疫苗和感染、器官移植等的免疫反应进行大规模分析，为疾病预警和诊断、治疗方法选择、疗效评估、预后分析等提供依据，也是发现具有临床价值的抗体标记、研究疾病发病机制的有力工具。 Genecopoeia提供用于转化医学研究的，针对自身抗体检测的芯片服务。除了预制的自身抗体检测芯片，还可提供定制服务。如需定制自身抗体检测芯片，请点击此处，填写服务表格。
2. 然后，将原始数据用参照点的值进行归一化，并将净信号强度(Net Signal Intensity, NSI)值以及信噪比(signal-to-noise ratios, SNRs)列在一个Excel文件中。
3. 标准分析的最后一步是确定“抗体评分”，即样品中给定抗体的相对富集程度。抗体评分以数字形式展示，并显示在热图中。得分越高(在热图上向红色移动)表明抗体-抗原相互作用越强，如下例所示：
4. 除标准数据分析包外，客户还可以选择定制数据分析服务。其中一项服务是使用基因本体（ Gene Ontology, GO）分析对阵列上的阳性抗原进行分类，该分析基于已知的生物功能对基因和蛋白质进行分类。分子功能GO分析的读数示例如下所示：
此外，生物过程的GO分析如下示例所示：
5. 另一个广泛用于生物信息分析的工具是KEGG (Kyoto Encyclopedia for Genes and Genomes) 通路分析，我们使用该工具根据已定义的生物通路对阳性抗体-抗原相互作用进行分组，如下所示：
服务流程
点击下载 服务指南 
样本要求
1. 适用于自身抗原芯片检测的常见样品 血浆、血清、淋巴、尿液、间质液、渗出液、细胞溶解液、分泌液等体液均可用于自身抗原芯片检测分析。
2. 样品的收集方法 a. 血清：采用不含抗凝剂的采血管采集全血，4℃放置30-45min后，4℃ 3000rpm离心10min，取上清，存于-80℃冰箱； b. 血浆：采用抗凝剂的采血管采集全血，4℃放置30-45min后，4℃ 3000rpm离心10min，取上清，存于-80℃冰箱； c. 尿液：收集不添加稳定剂的尿液样本后，4℃ 10000rpm离心1min或5000rpm离心2min，取上清，在干冰/甲醇浴中快速冷冻，储存在-80℃备用。
3. 样本量 为保证实验的顺利进行，体液样本的样本量请≥50 ul。
4. 样本寄送要求 a. 快递发出后请于当天将快递单号或专业化冷链物流托运单号及时告知乙方； b. 收货后乙方会对样品到达状态拍照，若样本送达状态不佳，可能需重新寄送； c. 体液样本请优先保存于干冰中寄出，干冰用量需足够以确保寄到时仍有干冰剩余； d. 不能使用干冰的情况下请使用冰袋，冰袋数量需足够以确保寄到使样本温度低于4℃；
报告形式
服务的实验结果将通过邮件形式提供相应的实验数据资料及报告文件。基本包括：
1) 蛋白芯片扫描图； 2) 杂交信号强度值； 3) 差异分析； 4) 聚类分析等。
自身抗原芯片检测自身抗体的流程
GeneCopoeia的OmicsArray™抗原微阵列包含多达120个纯化蛋白，这些蛋白被固定在玻璃载玻片上。同时，还包括8个标准化点样。每个载玻片携带16个相同的阵列，因此，可以同时处理多达15个样本以及1个阴性对照。每个样品只需要1 ul血清或50 ul其他体液。 如图1所示，患者样本孵育阵列中，样本中的任意抗体与阵列上的同源抗原结合。随后清洗阵列以去除未结合的抗体和其他蛋白质，然后与Cy3和cy5标记的二抗共孵育。双重标记设计旨在区分样品中存在的免疫球蛋白(Ig)亚型。例如，用Cy3标记的抗IgG二抗检测IgG抗体，用Cy5标记的抗IgM二抗检测IgM抗体。荧光团标记的二抗可用于检测IgA、IgD、IgE、IgG和IgM免疫球蛋白，以及IgG亚类IgG1、IgG2、IgG3和IgG4。 清洗去除未结合的二级抗体后，使用 GenePix®4400A 微阵列扫描仪检测信号。然后使用 GenePix®7.0 软件分析原始数据。
图1：GeneCopoeia的OmicsArray™抗原芯片检测样品中抗体的工作流程
FAQs
1. 在使用抗原芯片检测样本前，需要做哪些准备工作？
请在实验之前与售前进行充分沟通，说明实验目的，样本情况，以明确我方是否能满足您的需求以及确定实验方案。
2. 抗原芯片上都有哪些抗原？
抗原芯片上的抗原，全部是来自于文献报道的自身抗原。对于每种不同类型的抗原芯片，我们已展示相关抗原20个，在您确定 签署相应服务协议后，我们会给您提供全部的抗原及相关信息，在您使用自身抗原芯片的检测结果发表文章之前，请勿对第三方展示此信息。
3. 使用抗原芯片检测时，对样本数量有什么要求？
- 由于每张芯片上有16个block，其中一个用来做PBS对照，剩下15个用来孵育样本。所以客户所送样本的总数量最好为15的倍数，这样可以充分保证芯片的使用效率，避免让客户分担相应的损失成本。
- 理论上每个不同的检测组最低需要3个样本才能满足统计学上重复性的要求。在此基础上，样本越多，其结果对检测组的代表性越高。为了保证结果的可靠性，推荐不同检测组样本量≥30。
4. 抗原芯片的灵敏度、重复性、动态检测范围怎样？
抗原芯片采用荧光检测，其灵敏度要比ELISA(比色法)、Western（化学发光法）更加灵敏和稳定。片内和片间的技术重复相关系数R2均可以达到0.9以上。动态检测范围在1-65000。动态范围越大，说明所能检测的信号层次就越多。
5. 芯片定制的流程是什么，定制芯片的价格如何？ 如果您需要定制芯片，我们先需要与您就以下问题进行充分沟通：
- 抗原的知识产权情况（是来自于已公开发表的论文还是已受专利保护等），我们仅能提供不涉及专利保护的抗原定制检测；
- 抗原的基本信息（是全蛋白还是肽段，分子量，结构域，是否为膜蛋白等）；
- 您是否能提供满足定制芯片要求的抗原；
- 若需要我方提供待检抗原，相应费用及实验周期需另外核算。
6. 是否可进行预实验，预实验样本如何收费？
客户可以选择是否需进行预实验，若进行预实验，客户可提供15例样本（需符合样本要求），若您后续继续签署服务，且预实验的数据可用，再记入正常样品收费。
7. 芯片实验结果与WB结果不一致，该如何理解？
a. 这个差异也许与检测手段不同相关，芯片用的蛋白为非变性蛋白，和WB有所差别；芯片的杂交体系为抗原捕获抗体，与WB的抗原转膜后与抗体孵育也稍有差别，因此也许会造成部分差异； b. 需要客户提供WB验证的结果图，以便我们更好的分析分析客户验证的指标在芯片上的图像和数据情况；
8. 抗原芯片检测结果是不是可以直接发文章？
目前应用自身抗原芯片发表的研究类文章已经非常多。我们的自身抗原芯片已在全世界近百家医疗科研和医药企业得到广泛应用，已独立或和用户合作发表了几十篇论文。其中高影响因子的论文含数十篇。蛋白芯片技术可以极大提高科学研究的效率，更能够获得较为全面的数据，以在研究中得到创新的结果和结论，是科学论文发表的加分项。
自身抗体检测服务（AntigenProtein Microarrays）
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